1994 год был особенным в истории Эстонской Методистской Церкви. Достигнута давняя мечта – основан ВУЗ, заданием которого было подготовить пасторов, а также лидеров для работы в церкви.
Спустя три года после обретения свободы от советского режима Объединенная Методистская Церковь в Эстонии основала Теологическую Семинарию, и в августе 1994 года начались занятия с 54 студентами. Первым ректором был Андрус Норак, бывший пастор методистской общины в Тарту (второй по величине город Эстонии), который в том же году получил степень магистра богословия в духовной семинарии Эсбери в США. В создании ТС ЭМЦ важную роль сыграл д-р Уэс Гриффин вместе с супругой Джой, которых направил директор д-р Эдди Фокс из Всемирного Методистского Совета Всемирного Евангелизма в США. Д-р Х.Эдди Фокс был членом Попечительского совета ТС ЭМЦ до конца своей жизни (28 июля 2021 г.). Уэс Гриффин занимал должность академического декана с 1994 года до момента их возвращения в США в декабре 1995 года.
В течение летних месяцев 1994г. были изданы устав Семинарии и учебные планы, а также набраны преподаватели и другие сотрудники по назначению. Для приобретения высшего образования было запланировано в номинальном учебном времени четыре года, но уже в начале учебы было предложено о возможности ограничиться годичным основным курсом практической теологии. Уже в августе состоялся семинар открытия в Аа-ранд, в лагере нашей церкви. С осени началась регулярная учебная работа на улице Аптееги, в маленьких помещениях канцелярии церкви. Возможно в тесных условиях преподавателям и студентам придавало сил надежда, что в один прекрасный день мы будем иметь Семинарию, построенную в красивом и просторном здании, рядом с Кадриоргом.
Первый выпуск был и останется особенным в истории Семинарии. Пришли учиться люди, которые в трудные времена усердно и верно трудились в методистской церкви. И они, придя в Семинарию, были уже в зрелом возрасте. Тем не менее, это были удивительно старательные студенты, у которых был глубокий интерес и широкий кругозор. Учебе не препятствовало то, что некоторые из них служили в двух общинах и имели семьи с детьми. Преподаватели, которые были намного моложе своих студентов, также смогли много чего для себя подчерпнуть. С весны 1998 года Теологическая Семинария ЭМЦ стала государственным аккредитированным прикладным частным ВУЗом. Один из пяти ВУЗов в Эстонии, предлагающий теологическое образование.
В 2000 году началось обучение на заочном отделении, которое все больше набирало популярность. Рядом с методистами из года в год все больше и больше учатся и лютеран, баптистов, пятидесятников, членов свободных церквей.
Наш ВУЗ уникален тем, что почти одна треть студентов учится на русском языке, среди них латыши, украинцы и белорусы, несколько лет назад, студенты из Латвии начали учебу на английский языке. Предлагаетя синхронный перевод лекций на русский и английский языки. Все, кто заинтересован, изучают государственный язык, есть много возможностей практиковать его в ВУЗе. В каждом семестре лекции читают несколько гостей преподавателей различных духовных высших заведений с разных стран. Возможность обучать имеют кроме основных девяти преподавателей, также преподаватели-гости из других высших учебных заведений Эстонии, тем самым надеясь обеспечить высокий научный уровень преподавания.
В дополнение к предметам богословия и библейскому изучению в Семинарии есть возможность изучать несколько языков и различные факультативные предметы — начиная от психологии религии и заканчивая гимнологией. В рамках педагогического цикла можно получить подготовку учителя религоведения в общеобразовательной школе.
К настоящему времени Семинарию закончили 206 студентов (18 выпусков). Выпускники трудятся пасторами, лидерами молодежи, учителями, капелланами вооруженных сил и тюрьмах и различных других должностях. Из выпускников в нашей Семинарии преподают Анне Салурайд, Татьяна Семенова и Таави Холлманн, Кюлли Тынисте.
Что является уникальностью Теологической Семинарии ЭМЦ? Мы считаем, что большая часть библейского учения и тесная связь между теоретическим обучением и практикой. И как уже упоминалось, выделяет ВУЗ обучение студентов разных национальностей из разных церквей. Семинария уникальна тем, что учебная работа проходит в красивых, просторных и современных помещениях здания. Это большое Божье благословение для ВУЗа и церкви.